Gaussian 09

[eeddii]

Oldukça zahmet verilmiş başlığa
@eeddii, aslında ben derleme tarifini yaptığım iletimde bir iki şey söylemeye çalışmıştım. Sonradan @ct de değinmiş buna. Senin elindeki pakette derlenmiş dosyalar var muhtemelen, zira çıktılarında .exe'leri görüyorum. Deneyeceğin ilk şey hiçbir şey yapmadan indirdiğin şeyi açıp, g09 kullanarak bir girdi dosyası ile deneme yapman. Eğer arşivle beraber gelen test dosyaları da denenebiliyorsa onları da deneyebilirsin. Sanırım şu aşamada senin kurulumdan ziyade Gaussian için Linux üzerinde nasıl çalışılır onu araştırman gerekiyor.

Diğer bir yandan @bahdem'den de güzel bir öneri gelmiş

@heartsmagic girdi dosyası ile derlemeyi nasıl yapıcam ?

[heartsmagic]

Derleme derken?

Şimdi ortada iki durum var.

1. Gaussian kurulumu
2. Gaussian kullanımı

İlk sorun için şu aşamada bir şey yapmana gerek yok muhtemelen zira elindeki şey çalıştırılabilir bir şey. Kısacası kurulum adımını şu an geçelim. İkinci mesele ise uygulamanın kullanımı. O kısmı ne yazık ki ben bilemiyorum, Gaussian'ı tanıyan olarak senin bilmen gerekiyor. Windows üzerinde işler farklı yürüyordur belki, ancak burada sen elindeki basit bir girdi dosyasını denemedin henüz. Hiç olmadı onu bir denesen?

g09 isimli dosyanın olduğu dizinde:

Kod Seç Genişlet

./g09 girdi_dosyası

şeklinde denediğinde neler oluyor bir görelim. Aksi takdirde yol kat edemiyoruz bu şekilde. Bir de sen Gaussian'ın kendi sitesinden Linux, Unix için yönergelere baktın mı? Eğer bakmadıysan ne yazık ki o konuda bizler yine yardımcı olamayız.

[zeusmaster]

Gaussian'ı bildiğim kadarı ile iki farklı girdi dosya ile kullanabiliyorsunuz. Bunlar .gjf ve .com uzantılı dosyalar. Bu girdi dosyalarının içeriği tamamen sizin similasyonunuza bağlı. Girdi dosyasınını hazırlanışı da burada anlatılmakta. Aynı zamanda gerekli olursa programı çalıştırdığınız dizinde girdi dosyasına bağlı olarak fazladan dosyalarada ihtiyaç duyulabilir.

[guestwho]

@eeddii, şu örneği "H2.com" girdi dosyası olarak kaydedebilirsin; satır öncesi/sonrası boşluklar önemli bu arada:

Kod Seç Genişlet



#P b3pw91/aug-cc-pVDZ opt

H2 molecule optimization

0 1
H    0.0000000    0.00000000    0.0000000000
H    0.0000000    0.00000000    0.5900000000



Ardından bu "H2.com" girdisinden "H2.log" diye bir çıktı elde etmek için şu komutu yürütmelisin:

Kod Seç Genişlet

g09 < H2.com > H2.log

[ny33]

kurulumu yapabildinizmi? lütfen banada yardım edin...dediğiniz yolları denedim ama sanırım başaramadım...lütfen acil yardıma ihtiyacım var

[cagriemer]

Bu yazilim iki sekilde dagitiliyormus baslikta daha once gecen konusmalardan anlayacaginiz uzere. Sizin elinizde kaynak kod mu var yoksa ikilik olarak dagitilan mi?

[eeddii]

kurulumu yapabildinizmi? lütfen banada yardım edin...dediğiniz yolları denedim ama sanırım başaramadım...lütfen acil yardıma ihtiyacım var

gaussian09 değil ama 03ü yüklemeyi başardım. isterseniz konuyu kitleyebilirsiniz

[heartsmagic]

Ben gaussian09 için hâlâ geri bildirim alamamış olmamıza üzülüyorum zira bir emek var bu başlıkta. Son deneme isteklerini yaptın mı yapmadın mı acaba @eeddii? En son @guestwho güzel bir örnek paylaşmış? Hiç olmadı elindeki 03 ile çalışan veri dosyasını ya da her dosyasıysa onu yürütmeyi denedin mi?

[eeddii]

daha çok g03 için uğraştım. her şeye sıfırdan başlıyorum. g09 içinde çalışmalara başlayacağım. Eğer başarılı olursam onuda mutlaka paylaşırım.

[heartsmagic]

Seviniriz, zira g09 için de bilgi birikimi olur.

[zaforitos]

merhabalar,
ben G09 Rev D.01 (Lisanslı) son sürümünü kullanıyorum. Herhangi bir sorununuz olursa cevap verebilirim.

[eeddii]

gaussian 09 profile dosyasının içeriğini nano komutu ile bakıp buraya geçebilir misin ?

[hcy_61]

acaba bu programı denemek için paylaşabilirmisiniz.