Canlılar Neden Bozulmaz?

[XRumer]

NTVBLM Dergisi Haziran Sayısından Alınmıştır.

Canlı organizmaların bilgisayarlara kıyasla neden daha az "arıza" verdiği uzun süredir muammaydı. Yale Üniversite'sinden bir ekip, Linux işletim sistemiyle Escherichia coli bakterisinin kontrol şebekelerini karşılaştırarak durumu açıklığa kavuşturdu.

Mark Gerstein, "Genomun canlı organizmaların işletim sistemi olduğu" analojisinden yola çıkarak araştırmaya başladıklarını belirtiyor. Hem bakteride hem de Linux'ta iletişim ağları hiyerarşik bir yapıda, ancak işlem verimleri farklı. Bakterideki moleküler iletişim ağlarının yapısını, tepede az sayıda düzenleyici molekülün yer aldığı bir piramide benzetecek olursak, Linux'ta durum tam tersi; çok sayıda ana düzenleyicinin kontrolündeki birkaç genel mekanizmadan oluşan tepetaklak bir piramit söz konusu. Biyofizik, biyokimya ve bilgisayar bilimleri profesörü olan Gernstein'e göre sorunun kaynağı, para ve zamandan tasarruf etmek isteyen yazılım mühendislerinin, sıfırdan işletim sistemleri tasarlamak yerine var olan kalıplar üzerine çalışması. En küçük bir güncelleme mevcut organizasyonun kafasını karıştırıyor ve genel bileşenler üzerinde sürekli ince ayar yapılması gerekiyor.

Milyarlarca yıllık evrimle özelleşen modüllerden oluşan E.coli'nin kafa karışıklığı yaşamak gibi bir lüksü yok. Moleküler sisteminde karışıklığa yol açacak bir mutasyon, ince ayar yapamaması durumunda onun için öldürücü olabilir. Bu nedenle bakteri, kendisi için büyük risk oluşturacak "hazır parça"lardan yararlanma yaklaşımı yerine, son derece özelleşmiş kalıplar içeren bir düzenleme sistemini korumak ve sürdürmek durumunda kalmış. Gerstein'e göre bu düzenlenme stratejisi, milyarlarca yıllık evrim sürecinin sınavından geçmiş ve organizmayı zararlı rastlantısal mutasyonlardan koruma gücünü kanıtlamış bulunuyor.

[Bloodless]

Çok ilginç bir yaklaşımla başlamış makaleye

[XRumer]

Bir canlının yapısını anlamak için onu Linux'la kıyaslamak ilginç bir filir. Canlıyı anlama konusunda ilginç sonuçlar çıktığı gibi Linux'la ilgili ilginç sonuçlar da çıkıyor.

[özgürubuntu]

Ahh ben atacaktım bunu foruma

[canosayan]

peki windows ile karşılaştırınca?

[Bambal]

Pseudomonas aeruginosa ile karşılaştırsaydı ne guzel olurdu. Ben hayranım bu canlıya antibiyotiklere direnç, zor şartlarda hayatını devam ettirme ecoli ile kıyaslanmaz bile. El dezenfektanlarında bile yaşıyorlar.

[XRumer]

peki windows ile karşılaştırınca?

Karşılaştırmada Linux'un seçilmesinin nedeni açık kaynak olması. Açık kaynak olduğu için çalışma prensipleri biliniyor ve bir canlı formu ile karşılaştırılabiliyor ama Windows kapalı kaynak olduğu için arkaplanda nasıl çalıştığı bilinmiyor.