MPI RUN HATASI

Başlatan simyaci, 03 Nisan 2017 - 17:54:11

« önceki - sonraki »

0 Üyeler ve 1 Ziyaretçi konuyu incelemekte.

simyaci


sunucu'da 6 adte CPU kullanabilmek amacıyla çalıştırdığım script için aşağıdaki hatayı alıyorum.
çalıştırdığım script aşağıda verilmiştır. Yardımcı olacak arkadaşlara teşekkürler.

#!/bin/bash
#SBATCH -t 00:10:00
#SBATCH -n 6
#SBATCH --ntasks-per-node=1
#SBATCH -p test_q

export MY_OPENMPI202=${HOME}/local/openmpi-2.0.2_gcc-4.7.2_shared
export PATH=${MY_OPENMPI202}/bin:${PATH}
export LD_LIBRARY_PATH=${MY_OPENMPI202}/lib64${LD_LIBRARY_PATH:+:${LD_LIBRARY_PATH}}
/home/orca_4_0_0_linux_x86-64/orca PECHPCL2.inp > PECHPCL2.out &
exit





mpirun has detected an attempt to run as root.
Running at root is *strongly* discouraged as any mistake (e.g., in
defining TMPDIR) or bug can result in catastrophic damage to the OS
file system, leaving your system in an unusable state.

You can override this protection by adding the --allow-run-as-root
option to your cmd line. However, we reiterate our strong advice
against doing so - please do so at your own risk.
--------------------------------------------------------------------------
[file orca_main/gtoint.cpp, line 139]: ORCA finished by error termination in ORCA_GTOInt